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使用高解析度DNA定序法來分析台灣九族族原住民與台灣漢人HLA class II DRB1,DRB3/4/5及DPB1基因的遺傳多態性：應用於探討台灣原住民的起源與擴散
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| ioe:pub:5423 |
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| 書目文獻 |
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| 相關族群:台灣原住民 關鍵字:體質 關鍵字:遺傳 關鍵字:醫學 關鍵字:基因 關鍵字:遷徙 |
| Description： |
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| 摘要:人類白血球抗原(HLA)是目前已知的功能基因中最具多態性的基因群。因為HLA基因高度的多態性，可藉由此基因多態性的分析結果，再佐以文化、考古及語言學等證據，以瞭解族群間的遺傳類緣關係，並探討與重建族群的遷徙與起源。 本文使用DNA定序法(SBT)，分析台灣九族原住民（阿美族、泰雅族、布農族、排灣族、卑南族、魯凱族、賽夏族、鄒族與雅美族）及台灣漢人的HLA class II基因群中DRB1、DRB3/4/5及DPB1三基因。等位基因頻率及單倍體(DRB1-DRB3/4/5、DPB1-DRB1及DPB1- DRB1-DRB3/4/5)頻率採用最大相似值法計算得知，再由等位基因頻率計算出遺傳距離，進而建立種系發生樹(phylogenetic tree)。 研究結果顯示，台灣原住民的等位基因數目少，等位基因頻率集中於少數的等位基因型。相對於台灣漢人而言，台灣九族原住民是同質性較高的族群，其中以雅美族的族群同質性最高。台灣漢人與台灣原住民不論在等位基因型，或等位基因頻率分佈上皆有差異。台灣原住民的HLA-DPB1基因集中於DPB1*0501型，以雅美族的38.0%最低，魯凱族的80.1%最高。HLA-DRB1基因在阿美族及雅美族中，其等位基因頻率分佈與其他族群差異較大，阿美族集中於DRB1*0404 (25.0%) 與DRB1*04051 (21.9%)；雅美族集中於DRB1*1401（40.3%）、DRB1*15021(12.8%)與DRB1*16021(17.7%)。單倍體頻率與遺傳距離的分析同樣顯示出阿美族及雅美族與其他族群的遺傳關係較遠，以及台灣漢人與台灣原住民九族在HLA基因遺傳上的差異。從種系發生樹可看出台灣原住民九族可分為三大群：第一群是排灣族、布農族 及魯凱族；第二群是雅美族；第三群則是其他五族，第三群的五族似乎又可細分為三群：一是鄒族；二是泰雅族及賽夏族；三是卑南族與阿美族。我們的研究中發現台灣原住民可能在不同的時間，由不同的地點來到台灣。 未來可以此研究的結果為基礎，與其他東南亞及菲律賓等地的南島語族族群，及南中國大陸的少數民族遺傳資料相比對，以釐清台灣原住民的起源與擴散問題，並期能更進一步能將此結果應用於瞭解整個南島語族的起源與擴散。（作者摘要） (作者摘要) Abstract:The polygenic HLA (human leukocyte antigen) gene complex is the most polymorphic cluster of functional genes known. The high polymorphism of HLA genes makes these functional genes ideal genetic markers for studying inter- relationships among various human populations. Combined the results of HLA polymorphism with evidences from socio-cultural, archaeological and linguistic studies, we may understand better the origin and dispersal of human populations. In this study we have used sequence-based typing (SBT) to analyze the degree of polymorphism of classⅡ HLA-DRB1, -DRB3/4/5, and -DPB1 genes in the nine Taiwan aboriginal tribes (Amis, Atayal, Bunun, Paiwan, Puyuma, Rukai, Saisiat, Tsou, and Yami) and Taiwan Han Chinese. The allele frequencies of each population are estimated by a maximum-likelihood method and used to calculate genetic distances between pairwise populations according to Nei』s formula. Phylogenetic tree is then constructed from these genetic distances. The results show limited genetic diversity of Taiwan aborigines, especially the Yami tribe. The distributions of allele frequencies of Taiwan aborigines versus Han Chinese are different. All the Taiwan aboriginal tribes have a high percentage of DPB1*0501 allele ranging from 38.0% in Yami to 80.1% in Rukai. Allele frequencies of HLA-DRB1 in Amis and Yami are different from those in other populations. The Amis tribe is characterized by high percentages of DRB1*0404 (25.0%), DRB1*04051 (21.9%). The Yami tribe is characterized by high percentages of DRB1*1401 (40.3%), DRB1*15021 (12.8%), and DRB1*16021 (17.7%). The results of haplotype frequencies and genetic distances also indicate that Amis and Yami are more different from the other populations. From the phylogenetic tree, nine Taiwan aboriginal tribes are divided into three clusters：the first one includes Paiwan, Bunun and Rukai; the second one is Yami; and the third one includes the other five tribes. The third cluster can be further divided into three groups: the first one is Tsou; the second includes Atayal and Saisiat; and the third includes Puyuma and Amis. In the future, when there are more genetic data from the Philippine and Southeast Asia populations, we may understand much more about the origin and dispersal of Taiwan aborigines in particular, and the Austronesians in general.（作者摘要） |
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| 原件數位化後格式:image/jpeg |
| Date： |
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| 著作時間:2000 |
| Rights： |
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| 典藏單位:中央研究院民族學研究所 |
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