台灣多樣化之棲地及其代表性魚種-淡水魚類
台灣原生的淡水魚類(含河口)約有232種，分布於不同地區及海拔的河段中，但其中有約1/3的魚種已演化為台灣才有的獨特魚種。

北台灣區

中台灣區

南台灣區

東台灣區

蘭嶼、綠島區

恆春半島西區

河川上游 台灣河川源自高山，因而上游水勢湍急，河床中有許多大石塊形成的水塘、石隙等不同棲所。 高身白甲魚 台灣鬚鱲 台灣鉤吻鮭 中華花鰍 短吻褐斑吻鰕虎 明潭吻鰕虎 台灣白甲魚

河川中游 坡度較緩、水量較豐、石頭較小，棲息地較多樣，有平瀨、急瀨、平潭、深潭、瀑布、澗道、迴水等。 粗首馬口鱲 平頜鱲 細斑吻鰕虎 台灣石[魚賓] 台灣間爬岩鰍 大眼華鯿

河川下游 河床變寬、水流平緩，魚種數量最多，可惜因嚴重的污染問題，現幾已被大量耐汙性高的外來種，如大肚魚和慈鯛科的吳郭魚、琵琶鼠魚所取代。 鯉 鯽 泥鰍 大肚魚 高體鰟鲏 革條田中鰟鲏 吳郭魚 琵琶鼠

台灣多樣化之棲地及其代表性魚種-海水魚類
由於臺灣海岸棲地非常多樣化，西岸為沙質淺灘，多河口及紅樹林，營養鹽豐富，除中表層的洄游魚種外，另有許多沙泥底棲魚種。而東岸水深則可達數千公尺以上，孕有黑潮暖流通過，除了大洋性魚種外，還有許多全球性的深海魚種。有海中熱帶林之稱，只佔全球海域0.3%面積的珊瑚礁則分布在台灣南北兩端及澎湖、小琉球、綠島及蘭嶼幾個離島，更孕育了1,500種以上多彩多姿的珊瑚礁魚類。

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